Poslovi unutarnje revizije definirani su Pravilnikom o unutarnjoj reviziji, a Odjel je obvezan podnositi redovita godišnja izvješća Središnjoj harmonizacijskoj jedinici u Ministarstvu financija. Uloga Odjela je ispitivanje cjelokupnog poslovanja i davanja preporuka za njegovo unapređenje kao i davanje prijedloga za uvođenje i poboljšanje financijskog upravljanja i kontrola. Samostalni odjel za unutarnju reviziju ministru unutarnjih poslova predlagat će strateški (trogodišnji) i godišnji plan na temelju kojega će se u MUP-u, po usvajanju i donošenju istog, obavljati unutarnje revizije. U budućnosti poslovi unutarnje revizije u svim tijelima državne uprave bit će regulirani Zakonom o sustavu unutarnje financijske kontrole u javnom sektoru koji je trenutno u saborskoj proceduri.
Načelnica Samostalnog odjela za unutarnju reviziju je gđa Ivanka Gračan, a za višeg unutarnjeg revizora imenovan je g. Mladen Vujić.